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中国两种地方猪种内源性逆转录病毒检测与亚型分析.pdf
目的 对我国特有湖南沙子岭猪和湖南大围子猪内源性逆转录病毒(porcine endogenous retrovirus，PERV)的存在与mRNA的表达情况进行检测，了解湖南沙子岭猪和湖南大围子猪内源性逆转录病毒携带情况及病毒亚型分布；并利用5个微卫星位点对以上两个地方猪种封闭群进行了遗传学多样性分析。 材料与方法 随机采取湖南沙子岭猪耳样31份及湖南大围子猪耳样20份，每份耳样分别抽提DNA和RNA样本。应用gag、pol特异性引物，分别用于检测PERV核心蛋白基因(gag)、多聚酶基因(pol)的存在与表达，同时，合成三对用于分型检测的特异引物env-A、eHv-B、env-C，应用PCR、RT-PCR扩增的方法，对31头湖南沙子岭猪和20份大围子猪耳部组织的DNA、RNA样品分别进行了PERV前病毒和PERV mRNA逆转录活性的检测，并鉴定每头猪携带PERV亚型。同时，利用5个微卫星位点(S0059、SWl032、SW781、SW974、SW951)应用PCR技术对以上两个地方猪种进行了遗传学多样性分析，通过计算等位基因频率、有效等位基因数(Ne)、平均遗传杂合度(H)和多态信息含量(PIC)，评估两猪种猪种内遗传变异。 结果①在所有被检的湖南沙子岭猪和湖南大围子猪个体样品中均检出了PERV特异性前病毒DNA的存在；在所检31头湖南沙子岭猪个体中，93.5％的个体基因组中同时有PERV的A、B两种亚型(记为env-AB)，另外6.5％的个体基因组中则同时有PERv的A、B、C三种亚型(记为env-ABC)；而在所检20头湖南大围子猪个体中，l00％的个体基因组中则同时有PERV的A、B、C三种亚型(记为env-ABC)；所有湖南沙子岭猪和湖南大围子猪个体的耳样组织中均未检测到单独存在的PERV的A亚型或B亚型或C亚型。②沙子岭猪和大围子猪5个基因座的平均等位基因数(Ne)分别为3.8563个、4.8085个，平均多态信息含量(PIC)分别为0.6462、0.6867，平均杂合度(H)分别为0.7922、0.8280。结论湖南沙子岭猪和湖南大围子猪中都存在PERV序列，且能以mRNA的形式表达；湖南沙子岭猪PERV病毒亚型以enc-AB为主，大多数缺失。PERV erv-C亚型；湖南大围子猪PERV病毒则全部为env-ABC亚型。两个猪猪种平
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